È ancora piccolo il settore biologico, ma la superficie dedicata a questa produzione negli ultimi anni è triplicata, raggiungendo 161.000 ettari nel 2016, mentre gli agricoltori biologici sono 7000.

L'interesse per la produzione biologica è dovuto principalmente alle sovvenzioni nazionali e alle misure 11 e 4 del Programma per lo Sviluppo delle aree rurali. Altro fattore importante è la crescente domanda di frutta e verdura biologica nell'UE, che è il secondo più grande mercato biologico nel mondo dopo gli Stati Uniti. Il mercato biologico bulgaro ha ancora una quota del mercato europeo non rilevante (2-3%). Nello stesso tempo il paese può essere visto come importante destinazione per gli investimenti esteri.

La quota maggiore della terra organica è dedicata alla frutta fresca e secca. Si tratta di 26 000 ettari di coltivazioni sopratutto di noci, mandorle, nocciole, prugne, ciliegie, lamponi, more ecc.

Nonostante il crescente numero di bio-fattorie in Bulgaria, c'è un tasso di sopravvivenza delle aziende biologiche relativamente basso. Questo dimostra una mancanza di conoscenze delle tecnologie e delle caratteristiche economiche della produzione biologica.